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Contenus :

ATL-Enz :  Situation d’apprentissage et d’évaluation :

Les étudiants sont placés dans des conditions de travail dans un laboratoire de recherche pour développer un projet visant à évaluer le rôle biologique de deux isoformes de l’enzyme lactate déshydrogénase (LDH) de muscle squelettique et de muscle cardiaque. Ils doivent proposer un protocole pour la purification d’une des deux isoformes. Les actions à mener au laboratoire seront sélectionnées d’une part en fonction de différentes ressources : cours (p.e. BBM3, BBM5), livres, analyse de la littérature et d’autre part du matériel et des réactifs disponibles au laboratoire (« boîte à outils »). Ce travail sera poursuivi et terminé au semestre 6 dans le cadre de l’EC ATL-Bio Enz par l’étude des paramètres cinétiques des isoformes.

Un portfolio de développement des compétences sera renseigné au fur et à mesure.

La démarche et les résultats seront valorisés par la rédaction d’un article scientifique. Lors de l’EC ATL-Enz seront rédigées les sections ‘matériel et méthodes’ et ‘résultats’. L’article sera finalisé lors de l’EC ATL-Bio Enz.

ATL-Bio : Il y a deux parties, enzymologie et Biologie moléculaire

I. Partie enzymologie

- Pour les étudiants n’ayant pas suivi ATL-Enz : poursuite du projet initié au semestre 5

- Pour les étudiants n’ayant pas suivi ATL-Enz : A l’aide d’un topo mis à disposition à l’avance pour préparation : L’objectif et de purifier et caractériser la LDH de muscle cardiaque. Les étudiants organisent eux-mêmes le poste de travail et préparent les tampons et les réactifs nécessaires pour les étapes d’extraction, précipitation des protéines, techniques chromatographiques et réalisent le suivi de la purification : dosage des protéines, de l’activité, repérage des sels, électrophorèse en conditions natives (détection de l’activité) et dénaturantes.

II. Partie Biologie moléculaire

Préparation de bactéries compétentes; Transformation bactérienne; Extraction, purification et digestion enzymatique d’un plasmide dans le but d’établir sa cartographie

Cours de biologie moléculaire des procaryotes: structure et fonction des molécules impliquées dans les mécanismes de réplication, transcription et traduction chez les procaryotes. Transposition aux techniques de biologie moléculaire

Cet EC BMP est un prérequis pour l'EC ATL Bio partie Biologie moléculaire

Plastes et mitochondries chez les végétaux. Régulation moléculaire du cycle de vie d'une angiosperme, Métabolisme secondaire des végétaux. Loi de Hardy Weinberg et auto-incompatibilité.
TP: "Germination du pois" et "activité enzymatique lors de la maturation du fruit".

Cet élément constitutif donnera les bases nécessaires afin d'étudier les évolutions de populations.

Description et explications de la loi d’Hardy-Weinberg. Explications de ce qu’est la sélection naturelle et comment elle impacte la biodiversité ainsi que la diversité génétique chez l’Homme. Les exemples de grandes maladies humaines seront abordés.  Les notions d'effet migratoire, de dérive, d’autofécondation, d'autogamie, et de consanguinité, de mutations seront développées et leurs conséquences sur les variations de fréquences alléliques, génotypiques et phénotypiques seront modélisées et démontrées. Les populations structurées et l'effet Walhund seront aussi décrits. La biologie évolutive et le début de spéciation seront abordés.