Apprentissage des Techniques de Laboratoire (ATL)

Contenus :

ATL-Enz :  Situation d’apprentissage et d’évaluation :

Les étudiants sont placés dans des conditions de travail dans un laboratoire de recherche pour développer un projet visant à évaluer le rôle biologique de deux isoformes de l’enzyme lactate déshydrogénase (LDH) de muscle squelettique et de muscle cardiaque. Ils doivent proposer un protocole pour la purification d’une des deux isoformes. Les actions à mener au laboratoire seront sélectionnées d’une part en fonction de différentes ressources : cours (p.e. BBM3, BBM5), livres, analyse de la littérature et d’autre part du matériel et des réactifs disponibles au laboratoire (« boîte à outils »). Ce travail sera poursuivi et terminé au semestre 6 dans le cadre de l’EC ATL-Bio Enz par l’étude des paramètres cinétiques des isoformes.

Un portfolio de développement des compétences sera renseigné au fur et à mesure.

La démarche et les résultats seront valorisés par la rédaction d’un article scientifique. Lors de l’EC ATL-Enz seront rédigées les sections ‘matériel et méthodes’ et ‘résultats’. L’article sera finalisé lors de l’EC ATL-Bio Enz.

ATL-Bio : Il y a deux parties, enzymologie et Biologie moléculaire

I. Partie enzymologie

- Pour les étudiants n’ayant pas suivi ATL-Enz : poursuite du projet initié au semestre 5

- Pour les étudiants n’ayant pas suivi ATL-Enz : A l’aide d’un topo mis à disposition à l’avance pour préparation : L’objectif et de purifier et caractériser la LDH de muscle cardiaque. Les étudiants organisent eux-mêmes le poste de travail et préparent les tampons et les réactifs nécessaires pour les étapes d’extraction, précipitation des protéines, techniques chromatographiques et réalisent le suivi de la purification : dosage des protéines, de l’activité, repérage des sels, électrophorèse en conditions natives (détection de l’activité) et dénaturantes.

II. Partie Biologie moléculaire

Préparation de bactéries compétentes; Transformation bactérienne; Extraction, purification et digestion enzymatique d’un plasmide dans le but d’établir sa cartographie